Het depot van het museum bevond zich in de kelder onder grondwaterpeil. Het risico van waterschade diende verkleind te worden door een nieuw bovengronds depot. Molenaar & Van Winden Walraad architecten maakten een ontwerp voor de verplaatsing.
Verder hebben diverse interne verhuizingen plaatsgevonden en een aanpassing van de entree. CDC verzorgde de bouwfysica en het installatieconcept. De uitdaging voor CDC lag hier op het gebied van de klimatisering, waarbij relatief nieuwe installaties hergebruikt konden worden.